Serwis Morski jest najważniejszym i najbardziej dynamicznie rozwijającym się segmentem usług świadczonych przez Baltic Engineering. Klientami są armatorzy krajowi i zagraniczni a także krajowe stocznie remontowe oraz porty. Usługi oferowane są w następującym zakresie:
* Kompleksowe remonty jednostek pływających,
* Diagnostyka i regulacje okrętowych silników wysokoprężnych i innych mechanizmów,
* Remonty siłowni okrętowych, a w tym poszczególne urządzenia takie jak:
- główne i pomocnicze okrętowe silniki wysokoprężne,
- przekładnie zębate,
- pompy wodne , olejowe i paliwowe,
- wirówki oleju i paliwa oraz separatory,
- sprężarki powietrza i sprężarki chłodnicze,
- turbosprężarki,
- kotły, zbiorniki ciśnieniowe i wymienniki ciepła,
- rurowe systemy okrętowe wszelkiego typu i przeznaczenia.
Baltic Engineering prowadzi prace nie tylko w lokalnych portach lub we własnym warsztacie lecz dysponuje kadrą która może prowadzić remont w czasie eksploatacji na morzu w formie latających brygad praktycznie w każdym porcie Europy.